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La dénitrification
Elle s’effectue en l’absence d’oxygène grâce à certaines bactéries qui vivent au sein des pierres vivantes et, en dehors du cas du bac récifal, dans les biodénitrateurs ("filtres à nitrates") et dans certains substrats des filtres "normaux" (Siporax, charbon de qualité et probablement autres substrats, ces données étant quasi¬ment absentes dans la littérature aquariophile). La dénitrification ne concerne que l’azote - disparition des nitrates par transformation en azote gazeux - et c’est le seul phénomène en cause dans les conditions anaérobies normales créées en aquarium, du moins selon ce qui est admis actuellement.
La nitrification
Elle s’effectue en présence d’oxygène grâce à d’autres bactéries qui vivent sur le décor plus, en dehors du cas du bac récifal, dans les masses filtrantes des filtres "normaux". La nitrification n’est qu’une partie des phénomènes en cause, elle s’inclut dans la minéralisation des matières organiques qui concerne donc l’azote, mais aussi tous les autres éléments, au sens chimique du terme, présents dans les matières organiques carbone, hydrogène, oxygène, phosphore, potassium, soufre et tous les oligo-éléments.
Un bac récifal équilibré fonctionne sans filtre "normal" et sans biodénitrateur. La nitrification s’y effectue en surface des "décors", et la dénitrification au sein des pierres vivantes.
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